TotalSegmentator v2
Narzędzie wiersza poleceń, które segmentuje 117 struktur anatomicznych (v2) w dowolnym TK modelami nnU-Net trenowanymi na ponad 1200 klinicznych TK — standardowy sposób pozyskania masek narządów do radiomiki, planowania dawki i cech kontekstu guza.
W skrócie
Co robi
pip install i jedno polecenie: narządy, kości, naczynia i mięśnie oznaczone wokselowo; osobne modele zadaniowe dodają kręgi, płaty płuc, skład ciała i inne.
Zadania, typy danych i nowotwory
Architektura
Dane treningowe
1204 badania TK (v1) z rutynowej praktyki klinicznej Szpitala Uniwersyteckiego w Bazylei, obejmujące wiele patologii, skanerów i protokołów; v2 rozszerza klasy i dane.
Ewaluacja
| Benchmark / zbiór | Miara | Wartość | Walidacja zewnętrzna | Źródło |
|---|---|---|---|---|
| internal test set (v1 paper) | Dice | 0.943 mean over 104 structures | nie | Źródło |
Jak uruchomić
pip install TotalSegmentator
TotalSegmentator -i ct.nii.gz -o segmentations/ # 117 structures (v2)
TotalSegmentator -i ct.nii.gz -o seg/ --task body # extra task models: body, lung_vessels, ...Status regulacyjny i przeznaczenie
Status regulacyjny cytujemy ze wskazanego źródła i może się zmienić. Modele „tylko do badań” nie służą do decyzji klinicznych.
Ograniczenia i błędy systematyczne
- Anatomia, nie guzy: nie segmentuje zmian.
- Niższa dokładność na bardzo niskodawkowych lub silnie zaartefaktowanych badaniach.
Źródła
Ta strona ma charakter edukacyjny — nie stanowi porady medycznej i nie zastępuje konsultacji z onkologiem. Decyzje diagnostyczne i terapeutyczne podejmuje wyłącznie lekarz specjalista.