Zbiór danych
Otwarte pobieranie
CC BY 4.0
HLA Ligand Atlas
Referencyjny peptydom tkanek prawidłowych: zbiór, z którym sprawdza się kandydata na neoantygen, żeby upewnić się, że zdrowa tkanka też go nie wystawia.
W skrócie
DostawcaUniversity of Tübingen (Rammensee / Walz groups)
DostępOtwarte pobieranie
LicencjaCC BY 4.0
class I ligands90 428
Uwagi o rozmiarze29 rodzajów tkanek od 21 dawców — tkanki prawidłowe, co czyni go punktem odniesienia dla tego, co NIE jest swoiste dla guza
FormatyCSV
ZadaniePrezentacja antygenu
NowotwórWiele nowotworów
Etykiety i adnotacje
Peptyd, tkanka, dawca i typowanie HLA dawcy; z natury wieloalleliczny, więc przypisanie do allelu wymaga dekonwolucji.
Szczegóły
Ta karta jeszcze tego nie dokumentuje.
Modele trenowane lub oceniane na tym zbiorze
- trening NetMHCpan-4.1 Health Tech, Technical University of Denmark (Nielsen lab) — wieloalleliczne peptydomy tkankowe, rozplątywane w trakcie treningu
- trening MixMHCpred 3.0 Gfeller lab, Ludwig Institute for Cancer Research / University of Lausanne
Źródła
Ta strona ma charakter edukacyjny — nie stanowi porady medycznej i nie zastępuje konsultacji z onkologiem. Decyzje diagnostyczne i terapeutyczne podejmuje wyłącznie lekarz specjalista.